生物工程系设有生物工程专业，分为生物制药和食品生物技术两个方向，具有生物化工硕士学位和博士学位授予权。生物工程系现有教师9人，博士学历比率达100%，承担化工学院本科、硕士及博士的专业课程教学，主要研究方向有生物医药及其剂型加工与应用、食品生物技术产品开发及应用、生物农药及其剂型加工与应用、生物肥料开发与应用、生物质表面活性剂开发及应用等。近年来，生物工程系教学成果显著，有多门课程被列为辽宁省一流本科课程，指导学生参加国家级、省级A类竞赛屡获佳绩。另外，生物工程系在现代农业、功能型食品、工业微生物菌种转化和分子生物学诊断等方面取得了突出的成绩。

主任：郝晓亮

副主任：姜忠良